制氮機工作流程是有吸附、再生、均壓、反吹、升壓五個過程。
第一步、中壓吸附：
由于碳分子篩表面的微孔大小與氧分子直徑大小相差無幾，在中壓情況下，碳分子篩會選擇吸附壓縮空氣中的氧氣，對氮氣不吸附，故氮氣由吸附塔頂部流出，從而實現產氮。
第二步、常壓再生：
在迅速放空情況下，碳分子篩會釋放所吸附的氧氣，使分子篩得到再生，以便下一次使用。
第三步、兩塔均壓：
一吸附塔工作結束后，在兩秒（時間可設定）內，工作結束塔的氣體向準備工作的吸附塔吹氣，這樣減少升壓時間，減少壓縮空氣用量，同時吸附塔內壓力變化較小，減少分子篩沖刷，減少壓力的疲勞程度，增加產氣量。
第四步、反吹沖洗：
工作塔會有少量氮氣通過一截止閥對放空（再生）塔進行沖洗，將分子篩中沒有放空的余氧趕掉，使再生塔的分子篩再生更充分。
第五步、氮氣升壓：
閥門組合控制主要利用的是氮氣緩沖罐讓氮氣通過閥門組，之后塔補充氮氣，吸附塔內的壓力會快速上升，這個時候便能在較短的時間內制取出符合要求的氮氣，從而減少壓縮空氣的用量。
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